Immunobiol., vol. 182, pp. 369-403 (1991)

Imperial Cancer Research Fund, Lincoln's Inn Fields, London, United Kingdom

HLA Class II Nucleotide Sequences, 1991 Compiled by STEVEN G. E. MARSH and JULIA G.

BODMER

Received and accepted February 12, 1991

Abstract The HLA Class II sequences included in this compilation are taken from publications listed in the accompanying paper, Nomenclature for factors of the HLA system, 1990 (1) and Nomenclature for factors fo the HLA system, 1989 (2). Where discrepancies have arisen between reported sequences the original authors have been contacted where possible, and necessary amendments to published sequences have been incorporated into this alignment. Future sequencing may identify errors in this list and we would welcome any evidence that helps to maintain the accuracy of this compilation. In the sequence alignments identity between residues is indicated by a hyphen (-). Unavailable sequence is indicated by an asterisk (""). Gaps in the sequence are inserted to maintain the alignment between different alleles showing variation in amino acid number.

References 1. BODMER,]. G., S. G. E. MARSH, E. D. ALBERT, W. F. BODMER, B. DUPONT, H. A. ERLICH, B. MACH, W. R. MAYR, P. PARHAM, T. SASASUKI, G. M .TH. SCHREUDER, ]. L. STROMINGER, A. SVEjGAARD, and P. 1. TERASAKI. 1991. Nomenclature for factors of the HLA system, 1990. Immunobiol. 182: 334. 2. BODMER,]. G., S. G. E. MARSH, P. PARHAM, H. A. ERLICH, E. D. ALBERT, W. F. BODMER, B. DUPONT, B. MACH, W. R. MAYR, T. SASASUKI, G. M. TH. SCHREUDER,]. L. STROMINGER, A. SVEJGAARD, and P. 1. TERASAKI. 1990. Nomenclature for factors of the HLA system, 1989. Immunobiol. 180: 278. Correspondence: STEVEN G. E. MARSH, Imperial Cancer Research Fund, Tissue Antigen Laboratory, PO Box No 123, Lincoln's Inn Fields, London WC2A 3PX, United Kingdom

370 . S. G. E.

MARSH

and J. G.

BODMER

DRB Sequences: ORBl*OlOl ORBl*0102 ORBl*0103 ORBl*lSOl ORBl*lS02 ORBl*160l ORBl*1602 ORBl*030l ORBl*0302 ORBl*040l ORBl*0402 ORBl*0403 ORBl*0404 ORBl*040S ORBl*0406 ORBl*0407 ORBl*040a ORBl*0409 ORBl*04l0 ORBl*0411 ORBl*llOl ORBl*1l02 ORBl*1l03 ORBl*1l04 ORBl*120l ORBl*1202 ORBl*130l ORBI *1302 ORBl*1303 ORBl*1304 ORBI *1305 ORBI*1401 ORBl*1402 ORBl*1403 ORBl*1404 ORBl*140S ORBl*070l ORBI*0702 ORBl*oaOl ORBl*oa021 ORBl*oa022 ORBI*OB031 ORBI*oa032 ORBI*oa04 ORBI*09011 ORBl*09012 ORBl*IOOl ORB3*OlOl ORB3*020l ORB3*0202 ORB3*0301 ORB4*OlOl ORBS*OlOI ORBS*0102 ORBS*020l ORBS*0202

1 10 GGG GAC ACC CGA CCA CGT TTC TTG TGG CAG CTT AAG TTT GAA TGT

C--

-C-

C--

-C-

C--

-C-CGA- T-C TCA-GA- T-C TCA-GAG-G-GAG-GAG-GAG-GAG-GAG-GA**' t*' t*' '*' **. t*' t*' '*' '*' t*' .* •••• **' **' '*' '*' t*t '* •• *_ t*' t*t '*' '*' '** •••• t*' '*' '*' **' C--

.*_ _*.

.*.

t"

'*' '*'

t*'

'*' **' .*' *__

t*'

'*' '*' .*' '*'

**. A-A-A-A-A--

'*'

A-A-A-A--

A-A-A--

.*- .*' '*' '*' '*' ,-**' .*. t"

tt,

tt,

-A-A-

'*' '*'

'*' •• , '*'

t"

tt,

*.

**' **. **.

**_

.*_ .__

t*' ••• , __

t*,

.*. '*'

'*' *__

A-t*t

-AA--

t*_ **.

-AT-T--

'*'

t*,

.*. '*'

--G --G --G --G --G --G --G --G --G --G --G --G --G **- --G **- --G

•••• *•• * •• _.

'*' .*' .*' •••• *, **'

GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA-

T-C T-C T-C T-C T-C T-C T-C T-C T-C T-C T-C T-C T-C T-C T-C T-C

GAGAGAGAGAGA-

T-C T-C T-C T-C T-C T-C

AAGAGAGAGAGAGACACACACA-

GAG-- G--T- -G-

C-C--

A--

-C-C--A --A --A --A --A --A --A

AGG AGG AGG AGG -C-CCACACACACACACA-

TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGGGGTCTCTCTCTCTC-

-C-C-C-C-C-C-C-C-C-C-C-C-C-C-C-C-

-C-C-C-CGGGG-C-C-C-C-C-C-C-CGG-C-AGGGGGGGGGGGG-

--G --G --G --G --G --G --G --G --G --G --G --G --G --G --G --G A-G A-G --G --G --G --G --G --G

-C-C-C-C-G-A-A-A-A-

--G --G --G --G --G --G --G --G --G --G --G

-A-

-C-C-C-C-C-C-

.*. **' **' '*' '*' **. -T-T-T-

GCGAGAGAGA-

.*_

***

HLA Class II Nucleotide Sequences

20

371

30

CAT TTC TTC AAT GGG ACG GAG CGG GTG CGG TTG CTG GAA AGA TGC ATC TAT AAC CAA

--C --C --C --C --C --C --C --C --C --C --C

T-T--

T---A

--C --C

T-T-T-T-T-T--

--C --C --C

*** ***

C--

--C --C --C --C

--A

--c

--C --C --C --C -AC --C --C --C --C --C --C --C --C --C --C --C --C --C --C --C --C --A --A --C --C --C --C --C --C --C --C --C --C -A- --C -A- --C --C --C --C --C --C --C -AT -AT

--C --C --C --C --C --C C-C C-C

-AC --C --C --C T-- AAC --C --C --C --C

--C --G --G --G ATC C-C C-C C-C C-C

--C --C --C --C --G --C --C --C --C --C --C --C --C --C --C --C --C --C --C --C --G --G --C --C --C --C --C --C --G --G --C --C

-A-A-A-A-A-A-A-A-A-A-A-A-A-A-A-A-A-A-A-A-ACACA-A-A-A-A-A-A-A-A-A-ACTCT-A-A-A-A-A-AG-G-C--ACACA-A-AGAG-G-G--

T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-G-T-T-T-T--

C-C--

C-C-C-C-C-C--

--G --G --G --G --G --G

c--

C-C-C-C--

C-C-C-C--

--G --G --G --G

C-C-C-C-C-C--

--G --G --G --G --G --G --G --G

C-C-C-C-C--

--G --G --G --G

372 . S. G. E.

MARSH

and J. G.

BODMER

DRB Sequences: ORBI*OIOI ORBI*0102 ORBI*0103 ORBI*ISOI ORBI*IS02 ORBI*1601 ORBI*1602 ORBI*0301 ORBI*0302 ORBI*0401 ORBI*0402 ORBI*0403 ORBI*0404 ORBI*040S ORBI*0406 ORBI*0407 ORBI*040B ORBI*0409 ORBI*0410 ORBI*0411 ORBI*1101 ORBI*1102 ORBI *1103 ORBI*1104 ORBI*1201 ORBI*1202 ORBI*1301 ORBI *1302 ORBI*1303 ORB I *1304 ORBI*130S ORBI*1401 ORBl*1402 ORBI*1403 ORBI*1404 ORBI*140S ORBI*0701 ORBI*0702 ORBI*oaOI ORBI*oa02l ORBI*OB022 ORBI*OB031 ORBI*OB032 ORBI*OB04 ORBI*090ll ORBI*09012 ORBI*IOOI ORB3*0101 ORB3*0201 ORB3*0202 ORB3*0301 ORB4*OI01 ORBS*OIOI ORBS*0102 ORBS*0201 ORB5*0202

40 GAG GAG TCC GTG CGC TTC GAC AGC GAC GTG GGG GAG TAC CGG GCG

-T-TAAAA-A-A-A-A-A-A-A-A-A-A-A-A-A-ACTCTAAAA-A-AAA-TAAAA-T-T-T-T-A-A-A--A -A-A-AAAAA-A-T-A-A-T-AGAAAAAAA-

-T-

-T-T-T-T-T-T-T-T-

C-C--

-T-T-

-CC--C-C-

-A-

-CT--

-A- A-- --T

C--

-A-

HLA Class II Nucleotide Sequences· 373

60

50

GTG ACG GAG CTG GGG CGG CCT GAT GCC GAG TAC TGG AAC AGC CAG AAG GAC CTC CTG --C --C --C --C

A-A-A-T--

--T --T --T --T

A-AGC

AGC AGC AGC

-TC -TC

-AG -AG -AG -AG

-C-C-

AGC AGC

--A --A

-C- --G

C--

-C- --G --T -TC -TC AGC

C--C-C-

AGC AGC

-G-G-

---

-T-TC

-C-C-

-TC

-C-

-TC --C --C --C --C --C

T-A-T-T-A-T-A-A-A-A-T--

A-A-T-T-T-A-A-T-T-T--

-C--T --T --T --T --T

T-T-A-A--

374 . S. G. E.

MARSH

and J. G.

BODMER

DRB Sequences DRBl*OlOl DRBl*Ol02 DRBl*0103 DRBl*150l DRBl*1502 DRBl*160l DRBl*1602 DRBl*030l DRBl*0302 DRBl*040l DRBl*0402 DRBl*0403 DRBl*0404 DRBl*0405 DRBl*0406 DRBl*0407 DRBl*0408 DRBl*0409 DRBl*0410 DRBI * 0411 DRBI *11 01 DRBI *11 02 DRBI * 1103 DRBI * 1104 DRBl*1201 DRBl*1202 DRBl*130l DRBl*1302 DRBl*1303 DRBl*1304 DRBl*1305 DRBl*1401 DRBl*1402 DRBl*1403 DRBl*1404 DRBI *1405 DRBl*070l DRBl*0702 DRBl*080l DRBl*0802l DRBl*08022 DRBl*0803l DRBl*08032 DRBl*0804 DRBl*09011 DRBl*090l2 DRBl*lOOI DRB3*0101 DRB3*0201 DRB3*0202 DRB3*0301 DRB4*0101 DRBS*OlOI DRB5*0102 DRB5*0201 DRB5*0202

70 80 GAG CAG AGG CGG GCC GCG GTG GAC ACC TAC TGC AGA CAC AAC TAC --T --A G-C GAGCGC--A G-C --C --A G-C --C -A-G- CG-A-A-G- CG-A-A--A G-C GA-A-A-A-A-A--A --A --A --A --A --A --A --A --A --A --A

G-C G-C G-C G-C G-C G-C G-C G-C G-C G-C G-C -G-

GAGA--C --C GAGA-AGA-A-

--A G-C -G-GG-C G-C --A G-C --A G-C --A G-C --A G-C --A G-C --A G-C -G-G-G-

--T

CT-A-A-G- CA-G- CACTCTCTCTCTCT-A-A-

--T --T GTG GTG

GTG GTG

--T -A-A-A-A-

-G--A G-C --A G-C

--T --T

GCGC-

-G-G-G-G--C --C

CGCACACA-A-

-AT -AT -AT -AT T--

HLA Class II Nucleotide Sequences . 375

90

100

GGG GTT GGT GAG AGC TTC ACA GTG CAG CGG CGA GTT GAG CCT AAG GTG ACT GTG TAT -C- -TG -TG

--C --C --C --C --C --C --C

-TG -TG -TG -TG

C-A C-A C-A C-A C-T C-T T-T

--A

--A --A --A G--

*** *** *** *** *** *** *** ***

--C T-T --C T-T

G--

G--

*** *** *** *** *** *** *** ***

-TG

--C T-T

-TG -TG

*** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

__ x __ x

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** ***

*** *** *** ***

*** *** *** ***

--C -TG --C -TG --C -TG *** -C- -TG --C -c- -TG *** *** *** *** *** *** *** *** *** -TG --C

C-T C-T C-T

G--

*** *** *** *** *** ***

*** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** ***

C-T

*** *** *** *** *** *** ***

C-T

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --C C-T -** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** -** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --G

-TG -TG -TG -TG

--C C-T --C C-T

G-G--

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --C C-T --C C-T --C C-T

--G

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

-TG A--

--C C-T --C C-T

-** G--

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

-TG -TG -TG -C- -TG -C- -TG

--C --C --C --C --C

C-A C-T C-T C-T C-T C-A

C-C--

C-C--

376 . S. G. E.

MARSH

and J. G.

BODMER

ORB Sequences: ORBl*OlOl ORBl*Ol02 ORBl*OlO) ORBl*lSOl ORBl*lS02 ORBl*160l ORBl*1602 ORBl*O)Ol ORBl*0)02 ORBl*040l ORBl*0402 ORBl*040) ORBl*0404 ORBl*040S ORBl*0406 ORBl*0407 ORBl*040S ORBl*0409 ORBl"OHO ORBl*0411 ORBl*110l ORBl*1102 ORBl"110) ORBI *1104 ORBl*120l ORBl*1202 ORBl*l30l ORBl*l302 ORBl*l30) ORBl*l304 ORBl*l30S ORBl*140l ORBl*H02 ORBl*H03 ORBl*1404 ORBl*HOS ORBl*070l ORBI*0702 ORBl"OSOl ORBl*OS02l ORBl*OS022 ORBI*OS03l ORBl*OS032 ORBl*OS04 DRBl*09011 DRBl*090l2 ORBl*lOOI DRB3*0101 DRB3*0201 DRB3"0202 DRB3*0301 DRB4*0101 ORBS"OIOI ORBS*0102 ORBS"0201 ORBS*0202

110 CCT TCA AAG ACC CAG CCC CTG CAG CAC CAC AAC CTC CTG GTC TGC

--T G-i*t

**'

,tt

**t

tt,

G-G--

t*. t*_ **' t*, t*' G-••• t*' t t , t*' **' ••• **' **' **. **' t., .*' **' **' t*' ••• **' **' **' **' .,. **' t*' **' _t'

'*'

.*.

.*.

--T --T

t*' **' **' ••• t*' **' t*' t*' t*,

.* •• *. '*' ••• **' **. t*' .*t **' **' t*, **' **' **' t*' t*' t t , t*'

.*. .*. .*.

t*,

t*' **'

tt,

t*' **' t*,

t._

t*' **'

tt,

**' **. t*'

tt,

.*.

t*' t*' **' *t,

**' t t , t*' **' .t •• **' **' t t '

.*.

*.

.*. **' '"

t*' '"

.*_ tt,

**' '" **' '" t t , t*' **' **' t t , --T --T --T t*' t t , **' **' t*' t*' t*' --T **' **' t*' t*' t*' **' **' --T

t*' t*, t*_ •••

t*'

tt,

tt,

t*_

t._

t,. t"

t*' **' **' **' t*' t*' t t . t*_ .*,. '" **' **' ••• t*. t*. t*, t*' t*, **_ **' t*' t*' '" t*, t*' t*' **' t*' **. t t ' **' *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** .**

*** *** *** *** *** ***

tt,

**'

tt,

tt'

*** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** ***

*** *** **' *** *** ***

*** **' *** *** *** ***

*** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** **' ***

*** *** *** *** *** ***

--T --T -G-

G-C G-C

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** **' *** **' **'

--T --T --T *** *** *** *** *** *** *** **' *** *** **' *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** **' *** *** *** *** ***

--T

G-C

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

--T --T

G-G-G-G-G-G-G-G--

--T -G-G-G-G-

A-A--

A--

A--

HLA Class II Nucleotide Sequences· 377

120

130

TCT GTG AGT GGT TTC TAT CCA GGC AGC ATT GAA GTC AGG TGG TTC CGG AAC GGC CAG

-T-

-T-T-T-

K*. **t

-Attt

**t **t

t._

.*.

**t

.*.

**t **_ **_ **t

-A-Att.

**t

**.

*tt

-A-

**t ** •• * •• *_

.*_

t*. t*. t*. **t

**~

.* •••

.*. .*. .*.

t

tt.

.t.

--T --T t*_

.*.

**. **_ **t

*.

t*t

.*.

t* • • • • tt • • t • • • • _* ••• _ t*t **t **t ** •• * •• **t **t t*_ Rtt **t **t **t **t *tt **t t*t **t t*t t*t * •• **t **t t*t t*t t*. ww. t t t **t **t **_ *** **_ **t *t_ ••• t*. t*t ** •• *. t t . **. t* • • w. t** **t **t **_ **t **t t i . t* • • **t **. **t t i • • *_ **. t*t t*t **t *.t **. **t t* • • tK. **t **_ **_ **t t*t **. t* • • t. t*t *t_ t*t **t

t._ t._

tt.

t*t

.t.

.*.

*** *** *** *** *** *** *** ***

.*_

.*.

*.

*_

.t. i._ .*.

t*t

**t

t*t

**t

.*_

t*_ t* •••• t*. **t ••• t**

t*t

t*t

t*t

**t t*_

t*t

.* •• *_

*xt **t

t*t

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

**t *** *** *** *** *** *** *** ***

.*_ .. _

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

tK.

*** *** *** ***

**_ **_ **t

*** *** *** *** ~** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

t*t

*** *** *** *** *** *** *** ***

** •• *_

.*. .*_ .*.

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

**t

t*t

t*t

t*.

**t *** *** *** *** *** *** *** ***

t*_ *** *** *** *** *** *** *** ***

--T --T --T t*. t*. t*. --T t*t

.*.

--T *** *** *** *** *** *** *** ***

**t

.t.

*** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

--T --T --T *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***.*** **~ *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

-A-

-A-A-A-

-A-A-

--T

A-A-A--

378 . S. G. E.

MARSH

and J. G.

BODMER

DRB Sequences DRBl*OlOl DRBl*0102 DRBl*0103 DRBl*lSOl DRBl*lS02 DRBl*160l DRBl*1602 DRBl*030l DRBl*0302 DRBl*040l DRBl*0402 DRBl*0403 DRBl*0404 DRBl*040S DRBl*0406 DRBl*0407 DRBl*0408 DRBl*0409 DRBl*0410 DRBI *0411 DRBI *11 01 DRBI * 11 02 DRBl*1103 DRBI * 1104 DRBl*120l DRBl*1202 DRBl*1301 DRBl*1302 DRBl*1303 DRBl*1304 DRBl*130S DRB1*1401 DRB1*1402 DRBl*1403 DRB1*1404 DRB1*140S DRB1*0701 DRB1*0702 DRB1*080l DRB1*08021 DRB1*08022 DRB1*0803l DRBl*08032 DRB1*0804 DRBl*09011 DRB1*09012 DRBl*lOOl DRB3*0101 DRB3*0201 DRB3*0202 DRB3*0301 DRB4*0101 DRBS*OlOl DRB5*Ol02 DRB5*0201 DRB5*0202

150 140 GAA GAG AAG GCT GGG GTG GTG TCC ACA GGC CTG ATC CAG AAT GGA

A-A-A--

A-A--

--C

--C A-A-**t *** **t *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** A--

A--

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** A--

*** *** *** *** *** *** **t *** *** *** **t *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** **t *** **t *** *** *** *** *** **t ***

A-A-A--

*** *** *** *.t ***

*** *** *** *** *** *.t *** *.t *** *.t *** **t *** *** *** *** *** *** **t **t

*** *** *** *** *** **t *** *** *** *** *** *** *** *** *.t

--C --C --C **t *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --G --C A--

*** *** *** **t *** *** *** *** *** *** *** A--

*.t **t *** *** *** **t

**t

*tt

**t

*** *** ***

--C

*.t *** *** *** **t *** **t

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** **t *** **t *** *** *** *** *** *** *** ***

**t

*** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** ***

**t

*** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --C A-A---C

A--

--C

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** A--

--G

--G --G

--G --T

A---T --T --T --T

HLA Class II Nucleotide Sequences· 379

170

160

GAT TGG ACC TTC CAG ACC CTG GTG ATG CTG GAA ACA GTT CCT CGG AGT GGA GAG GTT

--C --C --C

--A --A

--C --C --C --C

--A

*** *** ***

--C --C

t**

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

--C

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

--C --C --C

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** ***

*** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

T-C

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

--C

-C-

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

--C

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** --A --C --C --A *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** ***

--C --C --C

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --C --A *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --C -A--C --A --C --A T---C --A --C --A --C --C --A

--c --C

--A

-TT -TT

380 . S. G. E.

MARSH

and]. G.

BODMER

ORB Sequences: DRB1*0101 DRB1*0102 DRB1*0103 DRB1*lSOl DRB1*lS02 DRB1*1601 DRB1*1602 DRB1*0301 DRB1*0302 DRB1*0401 DRB1*0402 DRB1*0403 DRB1*0404 DRB1*040s DRB1*0406 DRB1*0407 DRB1*0408 DRB1*0409 DRB1*0410 DRB1*0411 DRBl *1101 DRBl * 11 02 DRBl * 1103 DRB1*1104 DRB1*1201 DRB1*1202 DRBI * 1301 DRBl*1302 DRBI * 1303 DRBl*1304 DRBI * 1305 DRBl*l40l DRBl*1402 DRBl*1403 DRBl*1404 DRBl*140S DRBl*0701 DRBl*0702 DRBl*OSOl DRBl*OS02l DRBl*OS022 DRBl*OS03l DRBl*08032 DRBl*OS04 DRBl*090ll DRBl*090l2 DRBl*lOOl DRB3*OlOl DRB3*020l DRB3*0202 DRB3*030l DRB4*OlOl DRBs*OlOl DRBS*Ol02 DRBS*020l DRB5*0202

180

TAC ACC TGC CAA GTG GAG CAC CCA AGT GTG ACG AGC CCT CTC ACA

tt,

tt,

tt,

t*' t*,

t*'

t*' tt,

t*t

ttt

,t, .* •• *.

.*.

tt,

'*'

'*' '*' '*' '*. t*' t*' '*' '*' '*' ••• t • • • *' '*' '*' t •• '*' '*' t*, t t , '*' t*' t*' '*' t*_ _*_

t*, t*, tt,

'*'

'*.

t*_

tt,

.*.

t ••

t*,

--C --C

--A

--C

--A

--A

--C --A --A --C --C C-t*' '*' t t t

--C C---C C--

'*'

tt,

tt,

t*, t*'

tt, tt, t ••

'*'

t*_ t*, t*_

t.,

'*.

--C

t*,

t._

'*' '*' '*' '*' •• _ t*' '*'

.*_

'*'

t*'

'*' '*'

.** *** *** *** ___ ***

*** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *.*

t., t*, **' t*' t t , '*' '*' **'

.*. t*_

*** *** *** .** t** ***

.*_

'*' '*'

tt,

*** *** *** **t *t. ***

*** *** *** *** *** .**

*** *** .** *** *** ***

t*'

ttt

t*t

'*' '*'

,t. '*' ,t •• *.

--A --A --A

--C

'*' '*' '*'

'*. '*'

t*. **' *t.

t*, '*' t*, t*, t*_ t*. **_ '*' ,t, **' --C

t*, t*'

t*'

--C C--

'*.

'*' '*. '*' '*'

'*. '*' t*'

.*. '* ••--A*. '*' '*'

--C

--A

--C

t*' t*.

.*. .*. t*,

t*_

'*' '*' **t _._ tt.

t*t

'*'

t*'

'*' '*'

'*' '*' '*' '*. '*' t*' '" '*' '*' ,t, '*' '*' ,.,

t*, t*'

t*, .** *** *** *** *** *** *** *** .** *** *** *.* *** *** ***

*** *** *** *** *t* ***

*** *** t** *t* t** t**

.** *** •• * t*t •• * ***

*** *** *.* *** *** t**

*** *** *** t*t *** **_

*** *** *** *** .** ***

-T-T-

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** .** *** *** *** --C --A --C --A

--C

--A

-*. *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

-T*** .** *** *** *** *** **t *** *** *** *** *** *** *** ***

--T

-T--A --C --A --c --A --C --A --A --C A-- -T-

--c

--T

--T

--C --C --C --C

G--

--G

HLA Class II Nucleotide Sequences . 381

190

200

GTG GAA TGG AGA GCA CGG TCT GAA TCT GCA CAG AGC AAG ATG CTG AGT GGA GTC GGG

tt.

t*t

t*t

ttt

tt.

**t

ttt

ttt

tt.

ttt

ttt

t*t

t*t

t*t

t*t

t*t

tt.

ttt

ttt

tt.

t*t

•••

t*t

t*t

t*t

tt_

t*t

ttt

ttt

at.

.t ••••

ttt

ttt

ttt

• • • • _.

t*_ t*. t*_

t*t

ttt

ttt

tt.

tt.

t*t

ttt

t*t

ttt

t*t

t*t

*tt

.*.

ttt

ttt

t*t

t*t

t*t

tt.

ttt

t*t

i.t

t*t

ttt

_t_ **t

ttt

t*_

t*.

t*t

ttt

.*. t*t

ttt

ttt

.*_ ttt

t*t

t*t

ttt

t*t

t.

tt_

.t.

tt •••••

t*t

*tt

t*_

**t

t*t

ttt

tt_

t*t tt.

t*t

tt.

t ••

* •••••

t*t

t*t

t*t

t*t

t*t

ttt

t*t

t*_

t*t

t*t

t*t

tt ••••

t*t

•••

ttt

at.

t*t

t*t

t*t

t*t

tt.

tt.

ttt

t*t

t*t

t*_

at.

ttt

t*t

ttt

t*t

ttt

ttt

t*t

t*t

tt.

t*t

t*t

t*t

t*. t*.

t*t

t*t

ttt

•••

t_ ••••

**t

t*t

t*t

t*t

t*t

.*.

t*t

ttt

.*.

**t

t*t

att

*tt

*tt

t*t

tt • •

*_

t*t

ttt

t t t t t t t t t t t t t*_ *••••••••••••••• ** .** **t *** *** *** *** *** *** *** *** * •• *** **. *** *** *** *** *** *** *** t** *** *t* *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

t*t

ttt

t*t

.*. *** *** *** *** *** *** ***

**. *** *** *** *** *** *** *t*

*.* *** *** **. *** *tt *** ***

*** *** t** *** --T _** _** t** *** *** *** **t t** ttt *t*

*** *** *** ***

.*_

•••

t*t

.*.

ttt t*t .*t .* •• * •• ** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *tt t** *** *t* tt* *** *** *** *** *** *t* ***

t*t

t*t

t*t

ttt

*** .** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *t* *** *** *** *** ***

*** **. *** *** *** *** *** ***

.*_ .. *

*** *** *** *t* *** *** **t ***

*** .** *** *** *** *** *** ***

t._ t*. *** *** *** *** *** *** *** ***

*t* *** **t *** *** *** *** t** a*t *** *t* *t* *** *** *** *t* t** *** tt*

*** **. *** t**

*.t *** *** ***

**. *** *** ***

t** *** *** t** *** *tt ***,**_

*** *.* *** ***

*** *** *** **t

*** *** t** t**

*** *** t*t ***

*** **t **t ***

*** *** *** ***

*** *** **t *t*

*** *** t** t**

*** *** **t t*t t** *** *** t*t t** *** *t* *** *t* *** t** *.* .** *t* ***

C--

_** t** t •• t.* .** .** *** *** *** .** *** *** *** *** *** *** --T --T _** *** *** *** *** *** *** *** t** *** *** *** *** *** *** **t --T -A-A-AA--A-

382 . S. G. E.

MARSH

and J. G.

BODMER

ORB Sequences: DRBl*OlOl DRBl*Ol02 DRBl*Ol03 DRBl*lSOl DRBl*lS02 DRBl*160l DRBl*1602 DRBl*030l DRBl*0302 DRBl*040l DRBl*0402 DRBl*0403 DRBl*0404 DRBl*040S DRBl*0406 DRBl*0407 DRBl*0408 DRBl*0409 DRBl*04l0 DRBl*0411 DRBl*1l01 DRBl*1l02 DRBl*1l03 DRBI*1l04 DRBI*1201 DRBl*1202 DRBI*1301 DRBI *1302 DRBl*1303 DRBI*1304 DRBl*130S DRBl*1401 DRBl*1402 DRBl*1403 DRBl*1404 DRBI*140S DRBI*0701 DRBI*0702 DRBl*0801 DRBl*08021 DRBI*08022 DRBI*08031 DRBI*08032 DRBl*0804 DRBl*09011 DRBl*09012 DRBI*IOOl DRB3*0101 DRB3*0201 DRB3*0202 DRB3*0301 DRB4*0101 DRBS*OIOl DRBS*0102 DRBS*0201 DRBS*0202

210 GGC TTC GTG CTG GGC CTG CTC TTC CTT GGG GCC GGG CTG TTC ATC --T --T --T --T --T

--T tt'

.*'

t*' •••• *_ t*'

.* ••• _ t*'

t*,

'*'

t*'

.*'

.*_

t*' t*' '*t t*'

'*'

t*,

.*'

t*' t*' t*' t*' t*'

t*t

•• t

.*.*.

'*' **' t*' '*' t*, t*' t*' t*, t*' t*' t*' **' t*' t*, **' t . t t* • • t*' t" **' t*t t •• **' *_ **' **' **' , •• t*_ t*_ .* •• **' '*. t*. **' t*' '*' t*' t*' t" t t . t • • **' '*' t*' '*' **' '*' ** •• *_ t*. --T --T --T t*, **' **'

••••••• *_

.*_

.*.

.* ••

*.

.*.

.*_

.*_ .*_ .... *'

_*.

.*.

•••• " t*t

'"

.* •• ,_ t*' •••

**' •••

*.

**'

'*. '*'

t*_

't,

t*_

t*, **' t*'

_*.

'*'

**'

'*'

t*,

.*' '*'

t*, t*' ** •• *_ **' **' ** •• *' '*' t*,

.*' .*'

t*' •••• * •• *_ .* •• * ••••••• t*, t*. t*' t*.

'*' '*'

**t *** *** *** '*' ***

t,* *** *** *** *,' ***

*** *** **' *** *** '"

t*, ** ••

--T

.,_ '*'

•• _ .*' .*' '*' *** *** **' **' **'

" • • ** *** *** *** *** *** '** *" *** *** '**

.* ••• _'*' *'* *** *** *** "* *'*

*** *** *** *** **' **'

*** *** **' *** *'* ***

.*. .*. t*'

'** *** *** *** '*' ***

'*,

t*, •••

*** *** *** *** '" ***

*** *** *** *** '** ***

'*'

t*'

'*' '*' '*'

t*'

t*. t*' ._.

*** '** *** *** *** *** **'

*** *** *** *** *** *** '**

*** *** '** *** *** *** ***

T-T--

--T --T

*** *** *** '** **' **' *** **' **' '** *** **' '*' '** '** **. *** "* '*'

--T *** *** **' **'

*** .~* *** *** *** *** *** '*' **' *t* *** *'* *** *** *** ***

*** *** *** ***

*** '" **' ***

*** *** *'* ***

*.* *** *** ***

*** *** ** • • ** *** *** **' ***

*** *** *** ***

*** **' '** ***

.** *** *** ***

--T *** *** *** *** *** *** '** *** *** *** *** *"

*** '** ***

--T *** **' *** *** **t t** *** *t* *** *** *** t** *tt *** ***

--T *** *** '*' *** *** '** *** *** '** *** *** **- **' *** **'

--T --T

--T --T --T

A-A

--A --A --A --A

HLA Class II Nucleotide Sequences . 383

220 230 TAC TTC AGG AAT CAG AAA GGA CAC TCT GGA CTT CAG CCA ACA GGA TTC CTG AGC TGA

-G-Gtt,

**' •••••• t*. **' t*' •••

* ••• *' ••••• _ t*' •• _ t*'

**' .*. t._ t*' ••• **' t._ .*_ t ••

.*_

.*. .*_

*** *** *,. *** **' *** **' ***

i •• • *' t*' •••• *.

t*t

**'

.*' .*' ** ••••• *. **'

_*.

**' t*_ **'

**'

t.t

.* ••

t*.

t ••

.*. '*. **.

t*. t*' t*_

t ••

**_ .* •• *. t*'

.*.

.*.

**' t*,

.*'

**' **.

**. **' **' **' _*_ **' **' '" t*' **' ••• **' t*. t*' _._ t*' **' **. **' •• t t*' ,., t*, ••• t*' ** •• *. **' '" t*. ** •• *' t*' **' t*' •••

**' t*' t*' ••• **' * •• *' •••• *_ **' **' t*_ t*' ••• **' t*. **' t*' *' **' **' t*' t*' **' t*' **' .*' **' .*' i t i . t*' t*' t t ' **' •••

.*. .* .•

**_ **'

t*t

.*_

**' t*' **'

.* .... **'

.*_ .*_ tt'

t*'

'*'

-G-G-G-

t*, **' **' **' -G-

.* •• * •• *_

t*' t*' .* •• * •• *_ t*, t*' **. **' t*, -G-

**' 't' t*' **' **'

.*'

t* • • *_ **'

.*'

tt,

t*, **' t*' ••• t*' •••

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** '** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** **' *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** '** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *.* *** *** **. ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** **' *** *** ***

*** *** **. **' *** *** *** ***

*** *** *** *" *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

'** *** *** **' *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

'** *** *** **. *** *** *.* *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** • ** **'

*** *** *** *.*

*** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *.* *** **' ***

*** *** *** ***

*** *** *** '**

*** *** *** ***

*** *** *** ***

*** *** *** ***

*** *** *** '**

*** *** *** **'

*** *** '** **'

*** *** *** '**

*** '*. '** **'

*** ** • *** t**

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** '*. *** *** *** *** *** *** ***

-C*** *** *** **. *** *.* *** *** *** *** *** _.* .** *** **' *** *** *** ***

*** *** **' **' **' ,*. '** *** *** *** *** *** *** *** **' **. *** *** '**

C-- T--A-

--G

--C

-A-

--G

--C

-A-

--G --G

--C

-A-

--C

C-- G--

c--

G--

C-- G-C-- G--

384 . S. G. E.

MARSH

and J. G.

BODMER

DQAl Sequences:

DQA1*0101 DQA1*0102 DQA1*0103 DQA1*0201 DQA1 *03011 DQA1*03012 DQA1*0302 DQA1*0401 DQA1 *05011 DQA1*05012 DQA1 *05013 DQA1*0601

DQA1*0101 DQA1*0102 DQA1*0103 DQA1*0201 DQAl *03011 DQA1*03012 DQA1*0302 DQA1*0401 DQAl *05011 DQA1*05012 DQAl *05013 DQA1*0601

DQA1*0101 DQA1*0102 DQA1*0103 DQA1*0201 DQAl *03011 DQA1*03012 DQA1*0302 DQA1*0401 DQA1*05011 DQA1*05012 DQAl *05013 DQA1*0601

10 1 GAA GAC ATT GTG GCT GAC CAC GTT GCC TCT TGT GGT GTA AAC TTG --T -AC -AC -AC *** *** *** *** -AC -A--T --C -A-A*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --T --T

40 TTC TAC GTG GAC CTG GAG AGG AAG GAG ACT GCC TGG CGG TGG CCT -A-

--T --T --T --T

-T-T-T-T-T-T-T-T-T-

-G-G-G-G-G-

AA-A-A-AT-T T-T T-T T-T T-T

-T-T-T-T-T-T-T-T-T-

70 80 GCA AAA CAC AAC TTG AAC ATC ATG ATT AAA CGC TAC AAC TCT ACC CTCTCTCTA-CTCTCTA-"

--T --T --T --T --T --T --T

-GT -GT -GT ---

C-G-G-G-C-C-C-C-C--

-C-C-C-C-C--T -C-C-C-C- *** *** ***

HLA Class II Nucleotide Sequences . 385

20

30

TAC CAG TTT TAC GGT CCC TCT GGC CAG TAC ACC CAT GAA TTT GAT GGA GAT GAG GAG C--TC--C--C -T-C- --T --G -G--C -C- --T --G -G--C -C- --T --C -G--G -CC---C -CC--CC--CC-*** *** -C--C C--T50

60

GAG TTC AGC AAA TTT GGA GGT TTT GAC CCG CAG GGT GCA CTG AGA AAC ATG GCT GTG CTCTCTCT-TT -TT -TT -TT -TT

C-C-C-C-C--

CAC-C-C---A --A --A --A --A

-G- C-- A--GA-- A-A -GA-- A-A -GA-- A-A C-A-C-A-C-A-C-A-C-A-90

--A --A --A --A --A --A --A --A --A

TTTTTTTTTTTTTTTTTT-

-C-C-C-C-C-C-C-C-C-

--C --C --C --C --C --C --C --C --C

--C --C --C --C

100

GCT GCT ACC AAT GAG GTT CCT GAG GTC ACA GTG TTT TCC AAG TCT CCC GTG ACA CTG *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --G *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

386 . S. G. E.

MARSH

and

J.

G.

BODMER

DQAl Sequences:

DQA~*OlOl

110 GGT CAG CCC AAC ACC CTC ATT TGT CTT GTG GAC AAC ATC TTT CCT

DQAl*0102 DQAl*0103 DQAl*020l DQAl *03011 DQAl*030l2 DQAl*0302 DQAl*040l DQAl*05011 DQAl*050l2 DQAl*050l3 DQAl*060l

*** *** *** *** *** *** *** --C --C *** *** *** *** *** *** *** --C --C --C -T*** *** *** *** *** *** *** -T--C *** *** *** *** *** *** ***

DQAl*OlOl DQAl*0102 DQAl*0103 DQAl*020l DQAl*03011 DQAl*030l2 DQAl*0302 DQAl*040l DQAl *05011 DQAl*050l2 DQAl*050l3 DQAl*060l

DQAl*OlOl DQAl*0102 DQAl*0103 DQAl*020l DQAl*03011 DQAl*030l2 DQAl*0302 DQAl*040l DQAl *05011 DQAl*050l2 DQAl *05013 DQAl*060l

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

140 150 GAG ACC AGC TTC CTC TCC AAG AGT GAT CAT TCC TtC TTC AAG ATC

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** 180 TGG GGC CTG GAC CAG CCT CTT CTG AAA CAC TGG GAG CCT GAG ATT *** *** *** *** --T --T *** *** *** *** --T

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** G-G-*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** G-G--

A--

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --A A-*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

HLA Class II Nucleotide Sequences . 387

120 130 CCT GTG GTC AAC ATC ACA TGG CTG AGC AAT GGG CAG TCA GTC ACA GAA GGT GTT TCT -A*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --C --C

--c

--c

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --C

--C

--c --c

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --C *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

160 170 AGT TAC CTC ACC TTC CTC CCT TCT GCT GAT GAG ATT TAT GAC TGC AAG GTG GAG CAC --T --C *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

-A-

C---G -G*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --G C--G*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

190 200 CCA GCC CCT ATG TCA GAG CTC ACA GAG ACT GTG GTC TGC GCC CTG GGG TTG TCT GTG --T *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --A --T A-A *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** A-A --A --A *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

--A *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

388 . S. G. E.

MARSH

and J. G.

BODMER

DQAl Sequences: OQAl*0101 OQAl*0102 OQAl*0103 OQAl*0201 OQAl *03011 OQAl*03012 OQAl*0302 OQAl*0401 OQAl *05011 OQAl*05012 OQAl *05013 OQAl*0601

210 GGC CTC GTG GGC ATT GTG GTG GGC ACT GTC TTC ATC ATC A-*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --G --C --G --G --C --G *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --G --C --G -** *-*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

DQBl Sequences: OQBl*0501 OQBl*0502 OQBl*05031 OQBl*05032 OQBl*0504 OQBl*0601 OQBl*0602 OQBl*0603 OQBl*0604 OQBl*0605 OQBl*0201 OQB1*0301 OQBl*0302 OQBl*03031 OQB1*03032 OQBl*0401 OQBl*0402

OQB1*0501 OQB1*0502 OQB1*05031 OQB1*05032 OQB1*0504 OQBl*0601 OQB1*0602 OQBl*0603 OQBl*0604 OQBl*0605 DQB1*0201 OQB1*0301 OQB1*0302 OQB1*03031 OQB1*03032 OQBl*0401 OQB1*0402

10 AGA GAC TCT CCC GAG GAT TTC GTG TAC CAG TTT AAG GGC CTG TGC *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** C-CT-C- A-A--TA-A-***

-T-T-

A--C- A-A-A-A-A-A--

40 GAG GAG TAC GTG CGC TTC GAC AGC GAC GTG GGG GTG TAC CGG GCA --G --T --G --T --G --A --G --T G---G -C--C --G -C--C --G -C--G -C--G -A- -T--G --A AT-CA -A--G --T --G -CA -CA --T --G --T --G -CA -C--T --G --T --G -C-

HLA Class II Nucleotide Sequences . 389

220

230

CAA GGC CTG CGT TCA GTT GGT GCT TCC AGA CAC CM GGG CCA TTG TGA

*** -G-G*** -G-G-G*** -G***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --C --C *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --C --C --C *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *.** *** *** --C *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

20

*** *** *** ***

*** *** *** ***

30

TAC TTC ACC MC GGG ACG GAG CGC GTG CGG GGT GTG ACC AGA CAC ATC TAT MC CGA

*** *** *** *** *-*** *** *** *** *---T

--T --T --T --T --T --T --T --T --T --T

--A --C --C --C

TACTCT- --A CT- --A CT- --A CT-GTACTCTCT-

-T-

50

T-T-T-T-AG-

T-T-T-T-T-T--

60

GTG ACG CCG CAG GGG CGG CCT GTT GCC GAG TAC TGG AAC AGC CAG AAG GAA GTC CTG AGC -AC ---A--C A-AGC -AC --C A---C -A-A-

-T- -T-T-T-T-T-T-T-

-T-C-C-C-C-

-CC -AC -CC -AC -AC -T- -AC -T- -AC

--C A--

. --T --T

--C A---C A--

390 . S. G. E.

MARSH

and J. G.

BODMER

DQBl Sequences: 80

70 DQBl*0501 DQBl*0502 DQBl*05031 DQBl*05032 DQBl*0504 DQBl*0601 DQBl*0602 DQBl*0603 DQBl*0604 DQBl*0605 DQBl*0201 DQBl*0301 DQBl*0302 DQBl*03031 DQBl*03032 DQBl*0401 DQBl*0402

GAG GGG GCC CGG GCG TCG GTG GAC AGG GTG TGC AGA CAC AAC TAC --A --A

DQBl*0501 DQBl*0502 DQBl*05031 DQBl*05032 DQB1*0504 DQBl*0601 DQBl*0602 DQBl*0603 DQBl*0604 DQBl*0605 DQBl*0201 DQBl*0301 DQBl*0302 DQBl*03031 DQBl*03032 DQBl*0401 DQBl*0402

CCA TCC AGG ACA GAG GCC CTC AAC CAC CAC AAC CTG CTG ATC TGC

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** -A- -A-

A-- A-- --A A-A-A-- A-A-- A-A-- AAA A-- A-A-- A-A-- A-A-- A--A- -A-A- -A-

GAGAGAGAGAG-GAGAGAGA-

T-T-T-T-T--

-C-C-C-C-C-

T-T-T-T--

-C-C-C-C-CC --A -CC --A

110

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

G-G-*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

G--

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

G-G-G-*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

G-*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

G--

HLA Class II Nucleotide Sequences . 391

90

100

GAG GTG GCG TAC CGC GGG ATC CTG CAG AGG AGA GTG GAG CCC ACA GTG ACC ATC TCC *** **- *** **- *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** **- **- *** *** *** *** *** **- *** ***

-T-T-T-

T-T-T--

*** *** *** *** **- *** *** ***

-G-G-

C-C-C-C-C-C-C--

T-T-T-T-T-T-T--

-A-A-A-A-A-A-A-

CTCTCTCTCTCTCT-

ACACACACACACAC-

-C-C-C-C-C-C-C-

T-T-T-T-T-T-T--

120

C-- C-C-- C-C-- C--

*** *** *** *** *** *** *** ***

c-- c-- *** *** **- *** ***

C-- C--

c-- c-- ***

*** *** **-

*** *** *** *** *** *** ***

C-- C--

130

TCG GTG ACA GAT TTC TAT CCA AGC CAG --C **- *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** **G-G-*** **- *** *** *** *** *** *** ***

.*.

G--

ATC AAA GTC CGG TGG TTT CGG AAT GAT CAG *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** **- *** *** *** *** *** *** *** *** *** **- *** **- *** *** *** *** *** *** *** --C

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** -A-

*** *** *** *** *** *** *** *** *** **- *** **- **- *** *** *** *** *** *** GC--C --A GC--C --C GC--A **- *** *** *** *** *** *** *** **- **- *** *** *** *** *** *** *** *** *** GC--C --A *** *** ***

--A

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** **. *** ***

GC-

--C

392 . S. G. E.

MARSH

and J. G.

BODMER

DQBl Sequences: OQB1*0501 OQB1*0502 OQB1*05031 OQB1*05032 OQB1*0504 OQB1*0601 OQB1*0602 OQB1*0603 OQB1*0604 OQB1*0605 OQB1*0201 OQB1*0301 OQB1*0302 OQB1*03031 OQB1*03032 OQB1*0401 OQB1*0402 OQB1*0501 OQB1*0502 OQB1*05031 OQB1*05032 OQB1*0504 OQB1*0601 OQB1*0602 OQB1*0603 OQB1*0604 OQB1*0605 OQB1*0201 OQB1*0301 OQ81*0302 OQB1*03031 OQB1*03032 OQB1*0401 OQB1*0402

150 140 GAG GAG ACA GCC GGC GTT GTG TCC ACC CCC CTC ATT AGG AAC GGT

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *.* *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --T --T --T

--T

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --T

--T

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --T --T --T A-A-T

--T --T

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** A-T --T *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** A-T --T 180 TAC ACC TGC CAC GTG GAG CAC CCC AGC CTC CAG AGC CCC ATC ACC

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** -A-

-A-

-T-

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** -A-

-T-

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

-A-

-T-

DQBl Sequences: 210

OQB1*0501 OQB1*0502 OQB1*05031 OQB1*05032 OQB1*0504 OQB1*0601 OQ81*0602 OQB1*0603 DQB1*0604 OQB1*0605 OQB1*0201 OQB1*0301 DQB1*0302 OQB1*03031 OQB1*03032 OQB1*0401 OQB1*0402

GGC TTC GTG CTG GGG CTG ATC TTC CTT GGG CTT *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

--C

--G --G

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

--G *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

--C

--G

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --C

--G

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --C

--G

HLA Class II Nucleotide Sequences . 393

170

160

GAC TGG ACC TTC CAG ATC CTG GTG ATG CTG GAA ATG ACT CCC CAG CGT GGA GAT GTC *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *.* *** *** *** *.* *** *** *** *** *** *** *** -A-

--C

--T *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *.* *** *** *** *** --T *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --C -A-

--C

--C *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --C *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***-**~ **~ *** *** *** *** *** *** *** --C 200

190

GTG GAG TGG CGG GCT CAG TCT GAA TCT GCC CAG AGC AAG ATG CTG AGT GGC GTT GGA *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** -AA-*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** -** ***

--A *** *** *** *** *** *** *** ***

A--

*** *** *** *** A-*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *~*

A--

220

230

GGC CTT ATC ATC CGT CAA AGG AGT CGG AAA GGG CTT CTG CAC TGA *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

-A-A-

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

-A*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

-A- --C

-A-

--C

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** -A- --C --C --T -A*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --c *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** -A- --C -A--C --T

*** *** *** ***

394 . S. G. E.

MARSH

and J. G.

BODMER

DPAI Sequences: DPAl*0101 DPAl*0103 DPA1*0102 DPA1*0201 DPA1*0101 DPAl*0103 DPA1*0102 DPA1*0201 DPAl*OlOl DPA1*0103 DPA1*0102 DPA1*0201 DPA1*0101 DPAl*0103 DPA1*0102 DPAl*020l DPA1*0101 DPA1*0103 DPA1*0102 DPA1*0201 DPA1*0101 DPA1*0103 DPA1*0102 DPA1 *0201 DPA1*0101 DPA1*0103 DPA1*0102 DPA1*020l

10 ATC MG GCG GAC CAT GTG TCA ACT TAT GCC GCG TTT GTA CAG ACG *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** 40 GAT CTG GAC AAG AAG GAG ACC GTC TGG CAT CTG GAG GAG TTT GGC --T --A 70 80 AAC TTG MT ACC TTG ATC CAG CGT TCC MC CAC ACT CAG GCC ACC G-110 MC ACC CTC ATC TGC CAC ATT GAC AAG TTC TTC CCA CCA GTG CTC -G140 150 TTC CTG CCC AGA ACA GAT TAC AGC TTC CAC AAG TTC CAT TAC CTG

180 GAC CAG CCG CTC CTC AAG CAC TGG GAG GCC CAA GAG CCA ATC CAG

210 GGC TTC ATC GTG GGC ACC GTC CTC ATC ATA MG TCT CTG CGT TCT A-A-A--

HLA Class II Nucleotide Sequences . 395

20

30

CAT AGA CCA ACA GGG GAG TTT ATG TTT GAA TTT GAT GAA GAT GAG ATG TTC TAT GTG

*** ***

*** *** *** **-

CA-

50

60

CM GCC TTT TCC TTT GAG GCT CAG GGC GGG CTG GCT AAC ATT GCT ATA TTG MC AAC -G90

100

AAC GAT CCC CCT GAG GTG ACC GTG TTT CCC AAG GAG CCT GTG GAG CTG GGC CAG CCC --T 120

130

MC GTC ACG TGG CTG TGC AAC GGG GAG CTG GTC ACT GAG GGT GTC GCT GAG AGC CTC --A

--T

-CA 160

170

ACC TTT GTG CCC TCA GCA GAG GAC TTC TAT GAC TGC AGG GTG GAG CAC TGG GGC TTG G-190

200

ATG CCT GAG ACA ACG GAG ACT GTG CTC TGT GCC CTG GGC CTG GTG CTG GGC CTA GTC -C--G 220

230

GGC CAT GAC CCC CGG GCC CAG GGC A£C GTG TGA

396 . S. G. E.

MARSH

and J. G.

BODMER

DPBl Sequences:

DPB1*0101 DPBl *02011 DPB1*020l2 DPB1*0202 DPB1*030l DPB1*040l DPB1*0402 DPB1*050l DPB1*060l DPB1*OBOl DPB1*090l DPB1*1001 DPB1*1101 DPBl *1301 DPB1*140l DPB1*150l DPB1*160l DPB1*170l DPB1*lBOl DPB1*190l DPB1*0101 DPBl *02011 DPB1*020l2 DPB1*0202 DPB1*030l DPB1*0401 DPB1*0402 DPB1*050l DPB1*0601 DPB1*OB01 DPB1*0901 DPB1*1001 DPB1 *1101 DPB1 *1301 DPB1*1401 DPB1*1501 DPB1*1601 DPB1*1701 DPB1*lB01 DPB1*1901

1 AGG GCC ACT CCA GAG AAT TAC GTG C-T C-T *** *** *** *** *** *** *** C-T

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** TAC -T-TCT-T-T-TCT-T-T-T-T-

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

10 TAC CAG GGA CGG CAG GAA TGC --A -T-T-TTT-T-T-TTT-TC-TTC-TTTTTTC-TT-

C-T C-T *** C-T *** *** C-T *** *** *** *** *** *** *** C-T -TC-*** *** *** C-T -T-

40 GCG CGC TTC GAC AGC GAC GTG GGG GAG TTC CGG GCG GTG ACG -T-T-T-T-T-T-T-T-T-T-

--A

-T- -T-T-T-T-T-

TT-

--A -T-T-T-T-

HLA Class II Nucleotide Sequences . 397

20 30 TAC GCG TTT AAT GGG ACA CAG CGC TTC CTG GAG AGA TAC ATC TAC AAC CGG GAG GAG

--A C--

C--

60

50

GAG CTG GGG CGG CCT GCT -A-A-AG -A-A-AG -A-A-A-A-

GCG GAG TAC TGG AAC AGC CAG AAG GAC ATC CTG GAG GAG -A-A-A- --C

C--

-A-A- --C -A-A- --C -A-

C--

C--

-A- -A- --C -A- -A-A- -A- --C -A- -A-AG

C-C--

398 . S. G. E.

MARSH

and J. G.

BODMER

DPBI Sequences:

DPB1*0101 DPBl *02011 DPB1*020l2 DPB1*0202 DPB1*030l DPB1*040l DPB1*0402 DPB1*050l DPB1*060l DPB1*OBOl DPB1*090l DPB1*1001 DPBl *1101 DPBl *1301 DPB1*140l DPB1*150l DPB1*160l DPB1*170l DPB1*lBOl DPB1*190l DPB1*0101 DPBl *02011 DPB1*020l2 DPB1*0202 DPB1*0301 DPB1*0401 DPB1*0402 DPB1*0501 DPB1*0601 DPB1*OBOl DPB1*0901 DPB1*1001 DPB1*1l01 DPB1*1301 DPB1*1401 DPB1*1501 DPB1*1601 DPB1*1701 DPB1*lBOl DPB1*1901

70 BO AAG CGG GCA GTG CCG GAC AGG GTA TGC AGA CAC AAC TAC GAG CTG G-A-G G-A-G A-G G-A-G A-G A-G A-G

G-G-G--

G--G-

A-G

G--

A--

..,G-

A-G A-G A-G A-G A--

G-G-G--

110 AAG AAG GGG CCC CTG CAG CAC CAC AAC CTG CTT GTC TGC CAC GTG

T-T-*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** T-T-*** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

.*.

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** ***

*** ***

*** ***

*** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

HLA Class II Nucleotide Sequences . 399

GAC -G-G-G-

GAG -G-G-G-

GCC C-C-C--

90 GTG ACC CTG CAG CGC CGA GTC CAG CCT A-A-A-*** *** *** *** ***

-G- -G- C-- A--G- -G- C-- A--

100 AAG GTG AAC GTT TCC CCC TCC -G--T -G--T *** *** *.* *** *** *** ***

-G-G*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

-T- -G- C-- A--

-T- -G- C-- A--

*** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** ***

.*. *** *** ***

*** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** ***

*** *** *** *** *** *** ***

--T --T *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

120 130 ACA GAT TTC TAC CCA GGe AGC ATT CAA GTC CGA TGG TTC CTG AAT GGA CAG GAG GAA --G --G *** *** *** *** *** ***,*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --G

--G *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** **~

*** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

400 . S. G. E.

MARSH

and J. G.

BODMER

DPBl Sequences:

DPB1*0101 DPB1*02011 DPB1*02012 DPB1*0202 DPB1*0301 DPB1*0401 DPB1*0402 DPB1*0501 DPB1*0601 DPB1*0801 DPB1*0901 DPB1*1001 DPB1 *1101 DPB1 *1301 DPB1*1401 DPB1*1501 DPB1*1601 DPB1*1701 DPB1*1801 DPB1*1901 DPB1*0101 DPB1*02011 DPB1*02012 DPB1*0202 DPB1*0301 DPB1*0401 DPB1*0402 DPB1*0501 DPB1*0601 DPB1*0801 DPB1*0901 DPB1*1001 DPB1 *1101 DPB1*1301 DPB1*1401 DPB1*1501 DPB1*1601 DPB1*1701 DPB1*1801 DPB1*1901

140 150 ACA GCT GGG GTC GTG TCC ACC AAC CTG ATC CGT AAT GGA GAC TGG

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

180 TGC CAA GTG GAG CAC ACC AGC CTG GAT AGT TCC GTC ACC GTG GAG C-T C-T *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --C C-T

C-T C-T

A-*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

HLA Class II Nucleotide Sequences . 401

160

170

ACC ATC CAG ATC CTG GTG ATG CTG GAA ATG ACC CCC CAG CAG GGA GAC GTC TAC ATC T-T--

*** *** T-T-T-*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** ***

*** *** *** ***

-c-c-

--T --T

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** ***

*** *** *** ***

*** *** *** ***

*** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** ***

*** *** *** ***

*** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** ***. ***

*** *** *** ***

*** *** ***

*** ***

*** ***

*** *** *** ***

-C--T --T -c*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** ***

*** *** *** ***

190

*** *** *** ***

*** *** *** ***

*** *** *** ***

*** *** *** ***

*** *** *** ***

200

TGG AAG GCA CAG TCT GAT TCT GCC CAG AGT AAG ACA TTG ACG GGA GCT GGG GGC TTC -G-G-

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** -G-G-G-

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** .*** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** •• *

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

402 . S. G. E.

MARSH

and J. G.

BODMER

DPBl Sequences:

DPBl*OlOl DPBl *02011 DPBl*020l2 DPBl *0202 DPBl*030l DPBl*040l DPBl*0402 DPBl*050l DPBl*060l DPBl*080l DPBl*090l DPBl*lOOl DPBl *1101 DPBl*130l DPBl *14 01 DPBl*150l DPBl*160l DPBl*170l DPBl*180l DPBl*190l

210 GTG CTG GGG CTC ATC ATC TGT GGA GTG GGA --C --C *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** --C --C --C *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

CTC A-A-*** A-A-A-*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** **. ***

HLA Class II Nucleotide Sequences . 403

220

230

TTC ATG CAC AGG AGG AGC AAG AAA GTT CAA CGA GGA TCT GCA TAA

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***

*** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** ***